登記している場所と異なる場所で営業所を借りています。問題ありますか？

適法に営業所を借りているのであれば問題ありません。

自宅を本店として登記して、営業所を別に借りている場合がよくあります。

ただし、申請書には２段書きで記載する必要があります。

【登記上の本店と実際の本店の住所が異なる場合】
（登記上）千葉県柏市○○１－１－１
（事実上）千葉県柏市△△２－２－２

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